A magyar űrkutatás jelenlegi szervezetrendszere az 1992-ben kidolgozott koncepciót (MŰT, MŰI, ŰTT és az intézetek) alapul véve megalkotott 2011-es szabályozás szerint dolgozik. A Magyar Köztársaság minisztériumainak felsorolásáról szóló 2010. évi XLII. törvény szerint az űrkutatást felügyelő miniszter 2010. május 9-től a nemzeti fejlesztési miniszter. Az egyes miniszterek, valamint a Miniszterelnökséget vezető államtitkár feladat- és hatásköréről szóló 212/2010 (VII.1.) Korm. rendelet értelmében 2010. július 1-jétől a Magyar Űrkutatási Irodát a nemzeti fejlesztési miniszter irányítja. A MŰI korábban a Nemzeti Kutatási és Technológiai Hivatal osztályaként működött, a hivatalos átadás-átvételre 2010. utolsó negyedévében került sor.

A hazai űrkutatás irányítása három szervezet együttműködésnek eredménye: